Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms