Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SFTPDP35247 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFTPDP35247 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms