Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC1P33527 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms