Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPS1P31327 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPS1P31327 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms