Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DUSP1P28562 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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