Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGFR3P22607 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms