Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NF1P21359 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NF1P21359 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NF1P21359 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NF1P21359 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NF1P21359 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NF1P21359 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NF1P21359 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NF1P21359 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NF1P21359 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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