Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRG2P13727 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRG2P13727 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRG2P13727 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRG2P13727 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms