Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI3P10071 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI3P10071 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLI3P10071 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms