Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSBP07858 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms