Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSD2O96028 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms