Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCER2I3L3R5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms