Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRD1A4D1F6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRD1A4D1F6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms