Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TARSL2A2RTX5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms