Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms