Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAF6Q9Y4K3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms