Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2J1Q9Y385 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms