Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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IFT52Q9Y366 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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