Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATPIF1Q9UII2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATPIF1Q9UII2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms