Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms