Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms