Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms