Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXQ1Q9C009 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FOXQ1Q9C009 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FOXQ1Q9C009 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FOXQ1Q9C009 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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