Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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