Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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KRTAP1-5Q9BYS1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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