Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIFKQ9BYG3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NIFKQ9BYG3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms