Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5DQ9BY66 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5DQ9BY66 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms