Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms