Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms