Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms