Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SORCS2Q96PQ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms