Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4DQ92854 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms