Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms