Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXD4L3Q6VB84 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms