Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LETMD1Q6P1Q0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms