Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNS3Q68CZ2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNS3Q68CZ2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms