Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRIP1Q5VSL9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms