Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms