Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00242Q5T6M2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00242Q5T6M2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms