Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms