Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDK2Q58EX2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms