Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA9Q16795 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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NDUFA9Q16795 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFA9Q16795 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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