Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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