Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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