Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PCSK7Q16549 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCSK7Q16549 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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