Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDB1Q16531 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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