Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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NEDD8Q15843 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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NEDD8Q15843 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEDD8Q15843 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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