Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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