Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEBPEQ15744 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEBPEQ15744 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEBPEQ15744 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEBPEQ15744 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEBPEQ15744 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEBPEQ15744 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEBPEQ15744 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms