Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms